耳穴作为人体各部的微观反应点，除了用于针刺治疗外，还有诊断方面的价值。
耳穴在辅助诊断上的应用因耳廓与人体各部有着广泛的密切联系，所以当内脏或躯体有病时，尤其是器质性病变，多数患者就会在耳廓上相应部位出现敏感反应，这种病理改变还可以表现为皮肤变色、脱屑、丘疹等。如不少胃溃疡患者，耳廓胃区出现小点状，圆形的变异。这是一种有别于周围正常皮肤的病理反应。临床上根据耳穴的不同反应，可确定其相应部位脏器的疾患。在分析这些反应点时应注意：
①注意各反应区与全身各部的相互联系，根据祖国医学理论来分析。如心主神明，神经和精神系统的疾患可在心区有反应；脾与胃相互表里，胃与十二指肠溃疡、消化不良等病在胃区出现反应的同时，脾区也可能有反应。余同。
②注意与正常反应点的区别。健康人耳穴也有不同的反应，其鉴别方法可先看有无反应点，再在反应点压一压，如系假阳性，则压之不痛。此外，如耳廓上的色素沉着、白色结节、小脓疮、冻伤的疤痕等，均宜注意鉴别。
耳穴在治疗上的应用耳针的应用范围很广，不仅用于治疗许多功能性疾患，而且对器质性疾患也有一定治疗效果，还可应用于某些外科手术的麻醉。一般取相应部位的反应点(耳穴)，其选穴处方原则是：
①根据病变部位选穴 即按病变部位选取相应部位的耳穴。如胃痛选胃穴；腹泻选大肠穴、小肠穴；肩痛选肩穴等。
②根据中医理论选穴 即依脏腑经络学说及其生理、病理关系选穴。如皮、肺病选肺穴，是因“肺主应毛”，心律不齐选小肠穴，是因“心与小肠相表里”，偏头痛选胆穴，是因胆经循行“上抵头角”达于侧头；目赤肿痛选肝穴，是因“肝开窍于目”等。
③根据现代医学知识选穴 即按现代医学的生理、病理选穴。如月经不调选内分泌穴，胃肠疾患选交感穴，输液反应选肾上腺穴等。
④根据临床经验选穴 即依临床实践的体会，某点对某种疾病有效而选取。如高血压用高血压点， 目疾用耳尖穴等。
上述方法可单独使用，亦可两种或两种以上方法配合使用，力求少面精。一般每次应用2-8穴左右，多用同侧，也可取对侧，或两侧同用。
耳针的操作方法①寻找反应点 根据病情确定处方后，在选用区内探导反应点，可用按压法或用耳针探测仪。其压痛明显、皮肤电阻降低、导电量明显增高者，即为反应点，也就是针刺的部位。
②消毒 用75%酒精棉球涂擦耳廓，其消毒顺序是由内到外，由上到下，由前往后全面的消毒。
③针刺 根据需要选用0.5寸短柄毫针，或特定的图钉型揿针，以左手固定耳廓，右手持针垂直刺入。其深度以刺达软骨膜，而不穿透软骨为度，可用捻转手法，但不可用提插手法；操作要求准确、迅速。若行穴位注射，药物宜注射在软骨与皮肤之间。亦可用电针，还有用磁石、菜籽、豆子等作压迫刺激。
④留针 毫针刺一般留15~20分钟，慢性疾患可留针1~2小时或更长。留针期间可间歇捻针以加强刺激。如采用揿针可留5~7天。
⑤出针 起针时宜用消毒干棉球压迫针孔，防止出血，必要时可涂以酒精或碘酒，预防感染。
⑥疗程 毫针一般每天一次或隔日一次，连续10次为一疗程，揿针一般两周为一疗程。具体疗程和针刺的间隔时间须视病情而定。若一疗程结束，休息几天，再开始下一疗程。
应用耳针的注意事项①严密消毒，防止感染极为重要。耳廓冻伤或有炎症的部位禁针。若针眼发红、胀痛则可能有轻度感染，应及肘处理，密切观察。
②有习惯流产史的孕妇应禁用，妊娠期最好不针，若需用耳针治疗，也不宜取子宫、卵巢、内分泌、皮质下等耳穴，以免引起流产或早产。
③对年老、体弱、过度疲劳、饥饿、精神紧张的患者，针刺前应适当休息，针刺时宜取卧位，以防晕针，一旦发生晕针，应及时处理。
④对扭伤及肢体活动障碍的患者，进针后待耳廊充血发热，宜嘱患者适当活动患部，或在患部按摩，加灸等以增强疗效。
⑤耳针疗法虽然适应症广，但也有一定的局限性，有些病证的疗效往往不巩固，或仅能减轻某些症状，故应用时除充分发挥耳针治疗作用外，还需与其它疗法相配合。
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