《周易》和佛教联系当中最重要的是和华严宗、禅宗这两个宗派思想发生关系，这是因为它们和《周易》具有某些共同性。
《周易》学者和佛教学者都认为《周易》和华严宗思想是相通的。华严宗学者认为它的无相观念和 《周易》的六十四卦，384爻的变化原理是一致的。虽外，儒家也认为它的艮卦和华严思想是相通的，都表现了事物动静自如这样的基本观念。再比如，佛教认为它的华严思想和《周易》的整体观念是一致的，和"天人合一"观念也是一致的。所以华严学者当中有个叫李通玄的，就用《周易》来注解《华严经》，他写了《新华严经论》这一著名著作。禅宗中曹洞宗有一著名的开导学生的方法叫五位法，禅宗学者认为这个方法和《周易》的离卦、六爻的变化原理是一致的。
一些佛教学者为了引导儒家学者来研究禅，就用《周易》来解释禅。明末有位大学者叫智旭，就写了《周易禅解》。
另外，佛教学者对《周易》也有批评。他们批评了《周易》中"太极生两仪"的观点，认为"太极"若作为绝对的东西就不能生，生的东西就不能做为本源。还有《周易》认为精气是个物质，能变成游魂《"精气为物，游魂为变"》，佛教学者认为这是不对的，物质是无法变成精神的。这些对推动研究物质和精神的关系问题起了很大作用。
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