择吉系统中，各类神煞是古人据以判断日子吉凶的重要依据，而神煞也是择吉术中最复杂、最神秘的部分。《协纪辨方书》从第三卷开始，就对各类神煞进行了详细的介绍。
择吉术的神煞多达数百种，吉凶善恶都不尽相同。按照其运行出没的不同周期划分，可分为年神、月神、日神和时神四大类;如果以其领属划分，则可大致分为太岁、月令和干支五行三大系统。
以运行周期划分的神煞
包括四类：年神、月神、日神、时神。《协纪辨方书》在介绍神煞时，就依照运行周期来进行划分。
年神类神煞。如岁德、岁德合、岁禄、奏书、博士、太岁、岁刑、伏兵、大祸等。
月神类神煞。如阳贵、阴贵、三奇、临日、驿马、三煞、游祸、九坎、归忌等。
日神类神煞。如鸣吠、天恩、五合、伐日、上朔、反支、四离、四绝、气往亡等。
时神类神煞。如喜神、天官贵人、福星贵人、白虎、日建、日合、日刑、旬空等。
这四类神煞的判定，可参阅卷九·立成。
按领属划分的神煞
包括三类：太岁、月令和干支五行三大系统，以太岁系统为重太岁神煞系统。岁破、大将军、奏书、博士、力士、蚕室、蚕官、蚕命、丧门、太阴、吊客、官符、畜官、白虎、岁德、岁德合、金神、岁干合、岁支德等但其中只有奏书、博士、岁德、岁德合、岁干合、岁支德六位主吉。
月令神煞系统。月神多达一百多位，是依据月建和四时(四序)而构建成的个神煞系统。根据其性质，可分为善、恶、有宜有忌三类。善神如天道、天德月德、天德合等，恶神如地火、厌对、四忌、月煞、月刑等，有宜有忌的神煞如月建、月厌之类。
干支五行神煞系统。这是因天干地支和阴阳五行而起的神煞，其中的吉神有天恩、岁禄、四大吉时、五合、宝日等，凶神则包括破败五鬼、五离、八专、月忌、九丑等。
除了以上三种之外，还有诸多编外神煞，如华盖、宅龙、土公、催官、刺血煞、天寿等等，但这些神煞与太岁、月令、干支五行无关，因而被封建士大夫斥为伪神。
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